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siRNA，小干扰RNA（Small interfering RNA；或 short interfering RNA；或silencing RNA），指能引发RNA干扰效应的短（经典结构为19nt序列特异区域+2nt 3’悬挂，一般在20-25bp，也有一些设计到20-30bp）双链RNA；可以由体内内源产生，也可以由体外外源导入。

siRNA是RNAi技术的效应分子，通过与体内相关酶形成RNA诱导的沉默复合物（RNA-induced silencing complex,RISC）降解目标mRNA，调低或抑制目标基因的表达。

shRNA，短发卡RNA（short hairpin RNA），是指插入到相应表达载体（比如慢病毒）中的针对目的基因的特定序列（经过设计和筛选的高效且特异抑制目的基因）和特定结构（由loop序列区隔开的反向重复序列），在体内启动转录，形成发卡结构，在体内的DICER及RNase作用下，形成siRNA并诱导RNA干扰抑制特定基因表达。它通常由3个元件构成：一个转录启动子，一个shRNA前体序列和一个转录终止信号。

shRNA具有较强的基因沉默能力，在体内转录后经过酶切形成siRNA分子，通过与RNA干扰复合体（RISC）结合，降解特定的mRNA分子，进而对特定基因表达进行调控。shRNA技术已广泛应用于基因功能研究和基因治疗等领域。